要选择万方查重高还是知网查重高，首先需要考虑您的需求。如果您对学术期刊的查重要求较高，建议选择知网查重，因为知网查重覆盖了更多的学术资源，查重结果更全面。而如果您更关注国内期刊的查重情况，可以选择万方查重，万方查重在国内期刊方面较为专业。

另外，还需考虑您的经济实力和使用习惯。知网查重相对价格较高，适合有一定经济实力的用户；而万方查重价格相对较低，适合预算有限的用户。此外，还可以根据自己对两者的使用习惯和体验进行选择，以便更好地满足自己的需求。